Genetic research used to be data-driven under the framework of well-established gene theory. With the advance of various-omics technologies, large-scale data generation has become routine. However, data analyses have unexpectedly become extremely challenging due to the highly heterogeneous nature of bio-data. Furthermore, these diverse data sets seem to be inconsistent with some key predictions of gene theory. To briefly address this new reality, this editorial suggests a new genome theory to explain the new facts. By briefly comparing cytogenetics and gene sequencing research, the importance and key principles of chromosomal coded bioinformation is highlighted in the context of evolutionary studies and disease research.
Научные результаты биомедицинских исследований
2020. — Выпуск 1
Содержание:
Дисфункция бета-клеток поджелудочной железы, наряду с инсулинорезистентностью периферических тканей, является ключевым звеном патогенеза сахарного диабета 2 типа. В этой связи значительный интерес представляет изучение роли полиморфизмов генов, непосредственно участвующих в работе бета-клеток островков Лангерганса, в формировании предрасположенности к заболеванию. Цель исследования: Изучить связь полиморфного варианта гена кодирующего белок 2 связывающий мРНК инсулиноподобного фактора роста 2, IGF2BP2, (Т>С, rs11927381) с риском развития СД2 у жителей Курской области. Материалы и методы: В исследование были включены 559 больных СД2 и 540 практически здоровых добровольцев. Генотипирование полиморфизма гена IGF2BP2 (Т>С, rs11927381) было выполнено с использованием технологии iPLEX на геномном времяпролетном масс-спектрометре MassArray Analyzer 4 (Agena Bioscience). Статистическую обработку полученных данных проводили с помощью онлайн программы SNPStats. Результаты: Частота встречаемостигенотипа С/С была значимо выше в группе больных СД2 по сравнению с группой контроля (OR 1,75; 95%CI 1,25-2,44; P=0,0026). Ассоциация сохранила значимость и после введения поправок на пол, возраст и индекс массы тела (OR 1,87; 95%CI 1,26-2,78; P=0,0054). Стратифицированный анализ по полу показал, что выявленная ассоциация была характерна только для мужчин (OR 2,27; 95%CI 1,17-4,40; P=0,041), в то время как у женщин ассоциация не наблюдалась (P>0,05). Генотипы С/Т и С/С были ассоциированы со снижением содержания общего холестерина и липопротеинов низкой плотности у больных СД2 (Р
Ключевые слова
Актуальность: Изучение многофакторной природы формирования тревожности обусловлено ее участием во многих аспектах развития человека: физического и психического здоровья, функционировании эмоциональной сферы и общения, учебной деятельности и других. В свою очередь, излишняя тревожность может приводить к развитию различных психопатологий, включая депрессивное, суицидальное, аддиктивное поведение, что обуславливает ее социальную значимость. Кроме классических путей моноаминергической нейротрансмиссии в формирование индивидуальных различий в уровне тревожности могут быть вовлечены нейробиологические механизмы, обуславливающие вариации в синаптической пластичности и нейротрофике. Контактин-ассоциированно-подобный белок-2 (contactin associated protein-like 2, Caspr2, кодируется геном CNTNAP2, 7q35) является важным элементом, вовлеченным в регуляцию этого процесса. Изменения в последовательности гена CNTNAP2 связывают с формированием ряда психопатологий и аффективных фенотипов. Цель исследования: Целью настоящего исследования являлась оценка основного эффекта полиморфных вариантов rs2530310, rs2710102 и rs10251794 гена CNTNAP2 и гаплотипического эффекта в формировании индивидуальных вариаций в уровне ситуативной и личностной тревожности у психически здоровых индивидов 17-24 лет разной этнической принадлежности. Материалы и методы: Уровень ситуативной и личностной тревожности был оценен с помощью опросника Спилбергера-Ханина у 523 психически здоровых индивидов (75,7% женщин) из Республики Башкортостан (средний возраст 20,99±3,32 лет) разной этнической принадлежности. Генотипирование полиморфных локусов rs2530310, rs2710102 и rs10251794 в гене CNTNAP2 проведено с помощью ПЦР. Оценка основного эффекта полиморфных локусов и гаплотипов гена CNTNAP2 в вариации уровня тревожности осуществлялась в ходе линейного регрессионного анализа (PLINK v.1.09). Результаты: Была выявлена ассоциация полиморфного локуса rs10251794 гена CNTNAP2 с вариациями в уровне ситуативной тревожности как в общей выборке (в = 1,97; P = 0,002; Pfdr = 0,007), так и среди мужчин (в = 3,14; P = 0,011; Pfdr = 0,032) при рассмотрении аддитивного (A/A vs. A/T vs. T/T в локусе rs10251794) и доминантного эффекта аллеля (A/A + A/T vs. T/T в локусе rs10251794). Заключение: Полученные данные указывают на возможную вовлеченность гена контактин- ассоциированно-подобного белка-2, участвующего в регуляции синаптической пластичности и нейрогенеза, в формирование индивидуальных различий в эмоциональной сфере.
Ключевые слова
Актуальность: Ферменты фолатного цикла регулируют ключевые реакции в фолат-опосредованном одноуглеродном метаболизме. Нарушения фолатного цикла могут быть связаны с возникновением плацентарной недостаточности с синдромом задержки роста плода (СЗРП) у беременных, однако на сегодняшний день связь полиморфизма генов фолатного цикла с развитием патологии течения беременности изучена недостаточно. Цель исследования: Изучение ассоциации полиморфных локусов генов фолатного цикла с развитием СЗРП 23 степени. Материалы и методы: Выборку для исследования составили 112 беременных с СЗРП 2-3 степени и 243 беременных с нормальным весом новорожденного. Изучались полиморфные локусы генов фолатного цикла rs1805087 гена MTR, rs1801394 гена MTRR, rs1979277 гена SHMT1, rs699517 гена TYMS, rs2790 гена TYMS. Исследование проводили методом ПЦР с использованием соответствующих олигонуклеотидных праймеров и зондов с последующим анализом полиморфизмов методом детекции TaqMan зондов (real-time ПЦР). Анализ ассоциаций проводился с использованием программного обеспечения gPLINK v2.050. Межгенные взаимодействия в двух- и трехлокусных моделях анализировали с помощью метода MDR и его модификации GMDR. Результаты: Показано, что аллель Т rs1979277 гена SHMT1 ассоциирован с развитием СЗРП 2-3 степени в рамках аддитивной (OR=1,56, 95%d 1,10-2,22, р=0,012, р=0,011) и рецессивной (OR=2,55, 95%Q 1,24-5,22, р=0,011, рperm=0,007) моделей. Выявлена ассоциация аллеля G rs1805087 гена MTR с формированием СЗРП 2-3 степени в соответствии с рецессивной моделью (OR=3,28, 95/оС1 1,14-9,47, р=0,028, р=0,014). Выявлены две 2-х локусных и одна трехлокусная модели SNP х SNP взаимодействий, ассоциированных с развитием СЗРП 2-3 степени. В состав значимых моделей входят три полиморфных локуса - rs1979277 SHMT1, rs1805087 MTR и rs1801394 MTRR. Парное взаимодействие rs1801394 MTRR х rs1979277 SHMT1 является основой двух наиболее значимых моделей ген-генных взаимодействий, ассоциированных с развитием СЗРП 2-3 степени. Заключение: Полиморфные локусы rs1979277 SHMT1, rs1805087 MTR и rs 1801394 MTRR ассоциированы с развитием СЗРП 23 степени.
Ключевые слова
Актуальность: Важным аспектом поиска генов риска шизофрении является подтверждение полученных ассоциаций, выявленных в результате полногеномного анализа (GWAS), в выборках из отдельных популяций, а также установление их специфичности для этого заболевания. Цель исследования: Изучить связь между вариантом риска ZNF804A rs1344706 и шизофренией с учетом типа ее течения и шизаффективным расстройством (ШАР), а также некоторыми клиническими особенностями этих заболеваний, прогностически важными для оценки их тяжести. Материалы и методы: Выборка больных состояла из 1458 человек, из них 1284 с диагнозом шизофрения и 174 с диагнозом ШАР Контрольная группа психически здоровых испытуемых включала в себя 1051человека. Для оценки тяжести заболевания использовали возраст начала болезни и общий балл по широко используемой при изучении шизофрении шкале PANSS. Генотипирование полиморфизма ZNF804A rs1344706 проводили с помощью метода полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Результаты: Обнаружено повышение частоты генотипа риска АА в группе больных шизофренией по сравнению с контрольной группой (р=0,03. ОШ 1,31, ДИ 95% 1,03-1,7). Анализ связи полиморфизма ZNF804A rs1344706 с клиническими характеристиками выявил значимый эффект генотипа (р=0,007) на суммарный балл PANSS в общей группе больных. Наибольшая выраженность симптомов отмечена в группе носителей генотипа риска АА, а наименьшая - у носителей генотипа СС. Влияния генотипа на возраст начала заболевания не обнаружено. Заключение: Полученные результаты подтверждают известные данные, о том, что полиморфизм ZNF804A rs1344706 ассоциирован с заболеванием и его тяжестью, а вариантом риска является генотип АА.
Ключевые слова
Актуальность: Первичная открытоугольная глаукома (ПОУГ) относится к одной из самых распространенных и тяжелых форм заболеваний глаз, приводящих к слепоте и инвалидности. Глаукома у мужчин встречается в более чем половине случаев (65%). Цель исследования: Изучить вклад ген-генных взаимодействий полиморфных локусов матриксных металлопротеиназ в подверженность к первичной открытоугольной глаукоме у мужчин. Материалы и методы: Выборка для исследования включала 236 мужчин с ПОУГ (диагноз был подтвержден клиническими, инструментальными и лабораторными методами обследования) и 176 мужчин контрольной группы, не имеющих данного заболевания. Проведено молекулярно-генетическое исследование 8 полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ (MMP). Изучение SNPхSNP взаимодействий, ассоциированных с развитием ПОУГ, проводилось с использованием программы АРSampler. Результаты: Установлено 16 моделей SNPхSNP взаимодействий генов MMP (4 двухлокусных, 7 трехлокусных и 5 четырехлокусных) определяющих подверженность к развитию ПОУГ у мужчин (pperm
Ключевые слова
Актуальность: Около 10% беременностей в мире сопровождается гипертензивными расстройствами, при этом от 2 до 8% приходится на преэклампсию. Одним из компонентов патогенеза преэклампсии является плацентарная ишемия. Выделяющиеся при ней гуморальные факторы обладают провоспалительным эффектом и могут способствовать развитию эндотелиальной дисфункции. Одним из возможных вариантов сниженя эффектов этих цитокинов может явиться использование препаратов содержащих природные флавоноиды, одним из положительных моментов которых является снижение веноспецифического воспаления. Цель исследования: Исследовать эффективность использования очищенной микронизированной флавоноидной фракции при коррекции функциональных нарушений, возникающих при преэклампсии в эксперименте. Материалы и методы: Эксперимент выполнен на 100 белых крысах-самках линии Wistar массой 250-300 г. ADMA-подобный агент - (L-NAME) вводили внутрибрюшинно в дозе 25 мг/кг/сут в c 14 по 20 сут. беременности. Очищенную микронизированную флавоноидную фракцию (диосмин+флавоноиды в пересчете на гесперидин) в дозировках 86 мг/кг и 260 мг/кг вводили перорально однократно в сутки с 14 по 20 сутки беременности. На 21 сутки беременности проводили функциональные пробы и Комплексная оценка коррекции очищенной микронизированной флавоноидной фракцией нарушений при ADMA-подобной преэклампсии в эксперименте лабораторные исследования. Результаты: Введение лабораторным животным очищенной микронизированной флавоноидной фракции приводит к выраженной коррекции патологических изменений при экспериментальной ADMA-подобной преэклампсии с наибольшим эффектом в большей дозе используемого препарата. Отмечалось достоверное снижение систолического и диастолического давления соответственно, улучшение микроциркуляции в плаценте, восстановление NO-синтезирующей функции эндотелия, уменьшении протеинурии. Заключение: Результаты проведенного исследования свидетельствуют о перспективности применения очищенной микронизированной флавоноидной фракции для коррекции морфофункциональных изменений при преэклампсии и обосновывают целесообразность дальнейших исследований в этом направлении.
Ключевые слова
Актуальность: Одной из ведущих причин, приводящих к серьёзным осложнениям, длительной инвалидности и летальному исходу у матерей и младенцев, являются гипертензивные нарушения, а в частности преэклампсия, на долю которой приходится от 2 до 8 % от общего количества беременностей в мире. В структуре перинатальной смертности гипертензивные расстройства во время беременности составляют до 25% от общего количества случаев, а также занимают главенствующие места в структуре причин материнской смертности. Цель исследования: Изучить эффективность низкой дозы ацетилсалициловой кислоты и её комбинации с метилдопой на функциональные параметры, а также на росто-весовые показатели плодов крыс с ADMA - подобной преэклампсией. Материалы и методы: Исследование выполнено на 100 самках крыс линии Wistar, массой 250-300 гр. В эксперименте воспроизводили ADMA-подобную модель преэклампсии. Для оценки возникающих морфофункциональных нарушений использовали следующие параметры: артериальное давление, коэффициент эндотелиальной дисфункции, микроциркуляцию в плаценте, протеинурию, содержание жидкости в большом сальнике, концентрацию конечных метаболитов в плазме крови, морфометрические показатели плодов. Результаты: При оценке морфофункциональных нарушений у животных с ADMA-подобной преэклампсией, в ходе проведенного исследования установлено положительное влияние низкой дозы ацетилсалициловой кислоты в комбинации с метилдопой. Заключение: Комбинированное введение малой дозы ацетилсалициловой кислоты и метилдопы оказывает выраженную протективную активность при коррекции морфофункциональных нарушений у животных с ADMA-подобной преэклампсией и является перспективным направлением в лечении гипертензивных нарушений во время беременности.
Ключевые слова
Ключевые слова
Актуальность: В пожилом возрасте возрастная макулярная дегенерация имеет высокую распространённость и часто вызывает снижение и полную потерю зрения. Однако иммунологические механизмы развития данной патологии и их связь с изменениями оксидантной системы у пожилых больных остаются недостаточно изученными. Цель исследования: Анализ взаимосвязей показателей интерлейкинового профиля и оксидантной системы сыворотки крови у пожилых больных возрастной макулярной дегенерацией с поздней стадией (AREDS-4). Материалы и методы: Уровень сывороточных интерлейкинов и показатели оксидантной системы изучены у 57 больных в возрасте 60-74 года с возрастной макулярной дегенерацией 4-й стадии. Контролем служили 52 человека аналогичного возраста без указанной выше патологии. Содержание интерлейкинов определяли на проточном цитометре BD FACS Canto 2, а перекисное окисление липидов - на спектрофотометре СФ-16. Результаты: Установлено достоверное повышение анализированных сывороточных интерлейкинов и в большей степени IL-1P, IL-8 группы больных с возрастной макулярной дегенерациией в сравнении с возрастным контролем. Содержание противовоспалительных интерлейкинов и интерферонов-а, у достоверно снизилось у пациентов с рассматриваемым заболеванием, уровень продуктов перекисного окисления липидов статистические значило повысился. Между противовоспалительными интерлейкинами и показателями оксидантной системы выявлены обратные корреляционные связи, с изменением противовоспалительных интерлейкинов и показателей свободнорадикального окисления имеются обратные связи. Заключение: В результате проведенного исследования установлены особенности интерлейкинового профиля и оксидантной системы сыворотки крови у пожилых больных возрастной макулярной дегенерацией с поздней стадией, учет которых позволит рационализировать диагностику и патогенетическую терапию при возрастной макулярной дегенерации у пожилых.
Ключевые слова
Актуальность: Ассоциированный с артериальной гипертензией, нарушениями липидного и углеводного обмена метаболический синдром в пожилом и старческом возрасте встречается часто, что указывает на актуальность его изучения, в том числе исследование параметров артериального давления в утренние и вечерние часы. Цель исследования: Анализ показателей гемодинамики и особенностей липидного, углеводного обмена у пожилых больных с метаболическим синдромом и артериальной гипертензией. Материалы и методы: Вышеуказанные нарушения анализировались у 156 больных с метаболическим синдромом. Для определения артериального давления применялся аппарат АВРМ-04 фирмы Meditech. Углеводный и липидный обмен оценивались по общепринятым методикам. Результаты: У пожилых больных с метаболическим синдромом и артериальной гипертензией в сравнении с пациентами среднего возраста установлены достоверные различия в максимальной величине систолического и диастолического артериального давления, максимального индекса утренних часов. В вечерние часы выраженные различия в сравниваемых группах имелись для величин систолического и диастолического артериального давления. Установлена существенная дислипидемия и гипергликемия у пожилых больных с метаболическим синдромом в сравнении с контролем. На основе корреляционного метода в основной и контрольной группах выявлены достоверные прямые связи (r=+0,365 и r=+0,318, P
Ключевые слова
Актуальность: В связи с высокой нагрузкой во время обучения хронический стресс шире распространен среди студентов-медиков выше, чем в населении в целом. В результате возрастает тревожность и нейротизм, снижается работоспособность, появляются расстройства сна с высоким риском возникновения стресс-индуцированных психических расстройств. Цель исследования: Верификация распространенности и клинической структуры пограничные психических расстройств (ППР) у студентов медиков 1 и 5 курсов для разработки рекомендаций по первичной и вторичной психопрофилактике. Материалы и методы: Обследована сплошная выборка - 482 студента 1 и 5 курсов: 132 (27,4%) лиц мужского и 350 (72,6%) женского пола, в том числе: 265 человек 1 курса и 217 - пятого. Применялись клинико-психопатологический, медико-социологический и психометрический методы исследования. Для обработки базы данных использовались непераметрические статистические методы при помощи пакета прикладных статистических программ Statistica 6.0. Результаты: НИР диагностированы у 20% обследованных, чаще они выявлялись у студентов старших курсов - 24,4%, чем младших - 16,2%. В 18,8% случаев регистрировались непатологические донозологические реакции. Невротические, связанные со стрессом и соматоформные расстройства обнаруживались у 8,5% студентов, охватывая 42,7% среди всех ПНР. Реже выявлялись органические психические расстройства (5,0%) и расстройства личности (3,7%). Кроме того, в 2,7% случаев диагностированы аффективные расстройства настроения. Для студентов с ПНР и непатологическими реакциями более значимыми были половина учебных стрессовых факторов, более выраженные симптомы учебного и предэкзаменационного стресса, а младшекурсники чаще, чем сверстники без психических расстройств прибегали к табакокурению и употреблению алкоголя. Заключение: Фактором риска формирования ППР и непатологических реакций могут выступать роды посредством кесарева сечения, а прогностическим фактором - наличие в дошкольном возрасте фрагментарных невротических проявлений с обращением за помощью к адептам «народной медицины». С целью первичной и вторичной психопрофилактики пограничных психических расстройств во время обучения в ВУЗе целесообразна реализация тренинга «Стресс-менеджмент», направленного на обучение студентов конструктивным способам борьбы со стрессом, снижение уровня тревоги и депрессии.